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鱼类Foxl3基因的生物信息学分析
文献类型:期刊文献
中文题名:鱼类Foxl3基因的生物信息学分析
作者:姚竞杰[1];申祥[1];徐萍[2];徐小博[2];王三虎[1]
第一作者:姚竞杰
机构:[1]河南科技学院动物科技学院,河南新乡453003;[2]新乡学院生命科学技术学院,河南新乡453003
第一机构:河南科技学院动物科技学院,河南新乡453003
年份:2019
卷号:25
期号:17
起止页码:16-17
中文期刊名:安徽农学通报
外文期刊名:Anhui Agricultural Science Bulletin
基金:河南省自然科学基金(182300410086);新乡学院博士科研启动项目(1366020055)
语种:中文
中文关键词:Foxl3;鱼类;性别决定与分化;生物信息学
摘要:为进一步探明Foxl3的结构、功能信息,及其在鱼类性别决定和分化中的作用,利用生物信息学方法对欧洲黑鲈、青鳉、斑马鱼和虹鳟的Foxl3蛋白进行同源性、蛋白质理化性质、二级结构、功能结构域和三级结构分析。结果表明:欧洲黑鲈与青鳉、斑马鱼同源性较高,和虹鳟相似度不高,只有79%;鱼类的Foxl3蛋白分别编码269、264、260和296个氨基酸;该蛋白定位于细胞核,无明显信号肽和跨膜结构;主要的二级结构元件是α-螺旋和无规则卷曲,且α-螺旋所占百分比:虹鳟>青鳉>欧洲黑鲈>斑马鱼,无规则卷曲所占百分比:欧洲黑鲈>虹鳟>青鳉>斑马鱼;均包含1个Forkhead家族(FH superfamily)功能结构域。
参考文献:
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